شبیه سازی دینامیک مولکولی اثر کرکیومین و تری هالوز روی تجمع پپتید بتا آمیلویید

مکانیسم بیماری آلزایمر با رسوب تدریجی فیبر های آمیلوئید در ارتباط است. کشفیات اخیر نشان می دهد کرکیومین و تری هالوز می توانند بازدارنده تجمع بتا آمیلوئید باشند. به منظور بررسی مکانیسم ملکولی اثر بازدارندگی، شبیه سازی دینامیک ملکولی بتا آمیلوئید 22-16 در غیاب و حضور 2، 4 و 6 ملکول کرکیومین و تری هالوز به وسیله برنامه گرومکس 3.3.0 انجام شد، شبیه سازی ها نشان داد که با افزایش تعداد ملکول-های کرکیومین و تری هالوز، تجمع بتا آمیلوئید 22-16 کاهش می یابد. آنالیز ها نشان داد ملکول های کرکیومین در بین مونومر های بتا آمیلوئید 22-16 تجمع می کنند و مانع تجمع پپتید ها با یکدیگر می شوند. در پایان اثر بازدارندگی کرکیومین و تری هالوز به وسیله پارامتر های ساختاری مثل تابع توزیع شعاعی، تعداد پیوند هیدروژنی و فاصله انتها تا انتها مقایسه شد. نتایج نشان داد کرکیومین اثر بازدارندگی بهتری روی تجمع پپتید بتا آمیلوئید دارد. در محاسبه دیگری که بوسیله برنامه اتوداک انجام شد، انرژی اتصال میان کرکیومین و تری هالوز با پپتید بتا آمیلوئید به طور جداگانه مورد محاسبه قرار گرفت که این نتایج نیز کمتر بودن انرژی اتصال کرکیومین را نسبت به تری هالوز نشان داد.